Секреты
Бандана
Вы получите этот черный платок если вам удастся пройти игру так, чтобы Мерил осталась в живых. Тогда она подарит вам платок в финальном видеофрагменте. После того, как на экране пойдут титры вам покажут ваш результат и предложат сохранить игру - используйте эту возможность для того, чтобы начать новую игру в бандане - она между прочим, окажется королевским подарком - теперь у вас всегда будет неограниченное количество патронов для любого оружия. Надо только надеть бан-дану - и все в полном порядке. Больше не придется рыскать по уровням в поисках Фамас и Соком.

Стелc
Вы получите костюм Стелc если вы пройдете игру и закончите ее вместе с Отаконом. В ходе финального видеофрагмента, Отакон решит, что он больше не нуждается в своем камуфляже Стеле и подарит его вам. Затем, после того, как пойдут титры, вы сможете сохранить игру. Начните новую игру, загрузив эту сохраненную игру и тогда у вас среди прочих предметов будет и костюм Стеле - с самого начала игры. Как только вы его наденете, большая часть охранников и камер перестанут вас замечать. Только вот против собачек и боссов он действует не очень хорошо - практически бесполезен в подобных случаях. Также не удастся использовать этот костюмчик и в некоторых специальных моментах, где развитие событий от вас не зависит.

Смок
После того, как вы победите всех врагов, выиграете игру и получите как костюм Стеле, так и бандану, вы получите возможность сохраниться и в третий раз. Начните игру, загрузив это сохранение и тогда Змей в ходе всего своего приключения будет носить смокинг.

Ящики
Вы сможете использовать эти три ящика для путешествий между различными районами, вам надо будет просто запрыгивать на один из грузовиков, для того, чтобы либо въехать на территорию ядерного хранилища, либо попасть на вертолетную площадку - также доступным окажется Снежное поле. Вам просто надо будет написать на ящике адрес того места, куда вы хотите попасть, потом заберитесь внутрь и вас быстро доставят туда - появится грузовик и довезет вас до места назначения.

Волки
После того, как вы доберетесь до пещеры в первый раз, то в самом ее конце вы увидите Мерил, которая полностью очаровала собачек. Вам надо будет стукнуть Мерил и тогда она натравит на вас собак. Вам надо будет немедленно спрятаться в один из ящиков, после чего собачки на вас просто пописают, а могли бы и разорвать на куски. В результате от этого вы приобретете некоторую пользу -у вас будет знакомый запах и больше собаки вообще не будут вас замечать.

Демо Театр
Когда вы пройдете игру с обоими окончаниями и сохранитесь на диск, вы сможете активировать новую опцию на вашем специальном меню. Эта опция называется демонстрационным театром и она дает вам возможность посмотреть видеофрагменты из той игры, которую вам удалось пройти, причем это можно будет сохранить на карту памяти, так что в принципе можно ознакомиться с содержанием игры, практически не прикасаясь к контроллеру.

Альтернативные костюмы
Успешно завершите игру дважды, используя одинаковые сохраненные игровые установки. Змея оденется в смокинг в служебном подъемнике при третьем запуске игры. По слухам, если вы успешно завершите игру в третий раз Змея оденется в костюм ниндзя, но мы пробовали и это не работает.

Red Grey Fox
Доберитесь до лаборатории Отагона пока одеты в смокинг и появится Grey Fox (ниндзя). Он будет одет в красное.

Альтернативный титульный экран
Нажмите на любую кнопку контроллера во время титульного экрана для изменения цвета фона.